Thonjtë intramedularë zakonisht përdoren për të trajtuar frakturat e kockave të gjata, të tilla si femuri (kocka e kofshës) dhe tibia (kocka e këmbës). Disa situata të zakonshme që mund të kërkojnë një thon intramedular përfshijnë frakturat komplekse, traumat me energji të lartë, thyerjet e pabashkimit, mospërputhjen me vendimin për të mos lëvizur, etj. Përdorimi i thonjve intramedular do të varet nga rrethanat specifike të frakturës, shëndeti i përgjithshëm i pacientit dhe vlerësimi i kirurgut.